Генетический центр тяжести мамы и бабушки

Прошлым летом Сергей Козлов тестировал своих роботов-предсказателей генетического вклада разных народов в общей массе предков. На одном форуме о ДНК-генеалогии, я задал несколько вопросов и в резльтате после небольшой переписки, дал ему для анализа и корректировки его роботов-предсказателей данные мамы и бабушки. Через несколько дней он прислал мне интерпретацию разультататов и карты, на которых отмечен «генетический центр тяжести» предков.

Каждая карта представлена в 2 вариантах — с учётом влияния ашкеназской крови и без учёта такого влияния. Как ярко выраженные средиземноморцы, ашкенази сместили результат на юго-запад — в итоге самыми схожими получились выборки, не имеющие отношения ни к тем, ни к другим предкам, зато сочетающие в себе сходство с центральными русскими и средиземноморцами в наиболее близкой пропорции. Поэтому надо смотреть, что более корректные карты — без учёта ашкенази, но не забывать, добавить их в Средиземноморье.

Вот некоторые интерпретации из писем Сергея.

Для начала по бабушке. Оракул Admixture наиболее хорошо подходящей комбинацией посчитал

  • Russian_Ivanovo 77% + Sicilian 23% @ 2,23
  • Ashkenazi 23% + Russian_Ivanovo 77% @ 2,26

Пускай не смущают сицилийцы, по пропорциям предковых компонентов они близнецы с ашкенази, поэтому всегда выходят в комбинациях наравне с ними. По IBD-сегментам видно, что правильный вариант именно второй (ну это мы и так знали).

На карте с пометкой -NoA отрисован «генетический центр тяжести» после вычета 23% ашкеназского компонента, для московских русских результат хорошо подходит. На второй карте — уже центр тяжести по общему итогу влияния всех предков.

По маме более сложное сочетание, поэтому оракул двух предков должен давать отклонение от реальности. Но во всяком случае, по ближайшим оценкам доля ашкенази получается в районе 1/3

  • Russian_Bryansk 67% + Sicilian 33% @ 3,04
  • Russian_Tver 66% + Sicilian 34% @ 3,08
  • Russian_Tambov 69% + Sicilian 31% @ 3,12
  • Ashkenazi 32% + Russian_Tambov 68% @ 3,47

Пропорция согласуется и с оценкой по IBD-сегментам (примерно на треть больше ашкенази, чем у бабушки), хотя сами значения там были другими. В общем, где-то 3/8 ашкенази у неё и есть, видимо, по польско-литовским линиям дополнительных вливаний не было. Брянские и тамбовские русские представляют, что получится, если центральных русских смешать с поляками или украинцами (географически более логичные беларусы тут не годятся, поскольку из-за балтского компонента сдвигаются к литовцам и латышам).

Вот результаты предкового компонента по калькулятору 27:

Бабушкины предки
  • 0.35% Nilotic-Omotic
  • 0.77% Ancestral-South-Ind.
  • 41.25% North-European-Balt.
  • 2.58% Uralic
  • 0.59% Australo-Melanesian
  • 0.37% East-Siberian
  • 0.00% Ancestral-Yayoi
  • 13.35% Caucasian-Near-East.
  • 0.05% Tibeto-Burman
  • 0.00% Austronesian
  • 0.00% Central-African-Pygm
  • 0.71% Central-African-HG
  • 0.00% Nilo-Saharian
  • 2.09% North-African
  • 7.19% Gedrosia-Caucasian
  • 1.15% Cushitic
  • 0.00% Congo-Pygmean
  • 0.00% Bushmen
  • 0.00% South-Meso-Amerind.
  • 12.91% South-West-European
  • 1.73% North-Amerindian
  • 3.31% Arabic
  • 0.00% North-Circumpolar
  • 1.55% Kalash
  • 0.00% Papuan-Australian
  • 9.82% Baltic-Finnic
  • 0.22% Bantu
Мамины предки
  • 0.74% Nilotic-Omotic
  • 2.08% Ancestral-South-Ind.
  • 36.95% North-European-Balt.
  • 1.54% Uralic
  • 0.08% Australo-Melanesian
  • 0.17% East-Siberian
  • 0.00% Ancestral-Yayoi
  • 16.61% Caucasian-Near-East.
  • 0.00% Tibeto-Burman
  • 0.00% Austronesian
  • 0.00% Central-African-Pygm
  • 0.54% Central-African-HG
  • 0.00% Nilo-Saharian
  • 4.26% North-African
  • 7.58% Gedrosia-Caucasian
  • 0.51% Cushitic
  • 0.00% Congo-Pygmean
  • 0.00% Bushmen
  • 0.02% South-Meso-Amerind.
  • 16.07% South-West-European
  • 0.60% North-Amerindian
  • 3.49% Arabic
  • 0.00% North-Circumpolar
  • 1.19% Kalash
  • 0.68% Papuan-Australian
  • 6.87% Baltic-Finnic
  • 0.00% Bantu

И для мамы и для бабушки 84% принесли 5 групп:

  • North-European-Balt.
  • Caucasian-Near-East.
  • Gedrosia-Caucasian
  • South-West-European
  • Baltic-Finnic

Это стандартный набор для россиян средней полосы. То что нет конго-пигмеев или бушменов было понятно и так, а вот наличие пусть и малых количеств, но вкладов центрально-африканских пигмеев или тибетцев было для меня удивительным 🙂 Надо такое-же сделать себе и кому-нибудь по папиной линии тоже.

  • 22/03/2017
  • 2